Dans son numéro d’été 2023, le magazine ActuIA publiait un entretien avec Karim Beguir, cofondateur et PDG d’InstaDeep, consacré à l’intelligence artificielle multi-agents. Quelques semaines après la parution, le 31 juillet 2023, BioNTech finalisait l’acquisition d’InstaDeep. Malgré cette prise de contrôle, l’entreprise a conservé sa marque, sa direction et ses clients industriels. À la fin de l’année 2024, InstaDeep comptait plus de 400 employés, contre environ 240 au moment de l’acquisition. La collaboration entre InstaDeep et BioNTech remonte à 2019. En novembre 2020, alors que BioNTech développait son vaccin avec Pfizer, les deux sociétés ont créé un laboratoire commun d’innovation en IA à Londres et Mayence. Leurs équipes ont travaillé sur la sélection de néoantigènes pour les vaccins contre le cancer et l’optimisation des séquences d’ARN pour les plateformes RiboMab et RiboCytokine de BioNTech. L’un de leurs projets les plus marquants fut un système d’alerte précoce pour les variants du SARS-CoV-2. Ce système, déployé en janvier 2022, s’appuyait sur la modélisation de la protéine Spike et un modèle de langage pour analyser les séquences virales. Testé entre septembre 2020 et novembre 2021, il a permis de détecter 12 des 13 variants désignés par l’OMS en moyenne 58 jours avant leur reconnaissance officielle. Il a identifié le variant Omicron comme à haut risque dès le jour où sa séquence a été téléchargée, parmi plus de 70 000 variants découverts fin 2021. Selon Karim Beguir, seul un système d’IA pouvait traiter le volume de données généré à cette époque. Fondée à Tunis en 2014 par Karim Beguir et Zohra Slim, InstaDeep a transféré son siège à Londres en 2015. L’entreprise a levé 7 millions de dollars en 2019 auprès d’AfricInvest et 100 millions en 2022, avec BioNTech et Google parmi ses investisseurs. En janvier 2023, BioNTech annonçait l’acquisition de 94,7 % des actions d’InstaDeep pour environ 500 millions de livres sterling, incluant des paiements conditionnels. Il s’agissait de la plus grande acquisition de BioNTech et, selon TechCrunch, de la plus importante acquisition d’une startup africaine. InstaDeep fonctionne désormais comme une filiale britannique de BioNTech, avec Karim Beguir à sa tête. Il a reçu le TIME100 Impact Award en février 2024. En octobre 2024, BioNTech organisait sa première AI Day, au cours de laquelle elle dévoilait Kyber, un cluster de calcul puissant équipé de 224 GPU Nvidia H100 et de 86 000 cœurs CPU. En 2025, le bureau de Paris comptait plus de 130 ingénieurs et chercheurs. Les outils d’IA d’InstaDeep ont permis des avancées significatives en biologie, notamment des modèles analysant les séquences d’ADN et conçus pour optimiser la conception d’anticorps. L’entreprise a également élargi son champ d’action à des secteurs comme l’agriculture et l’ingénierie, avec de nouvelles collaborations et applications. En 2026, InstaDeep disposait de bureaux à Tunis, Kigali et Le Cap, avec une attention croissante portée à l’intelligence géospatiale et à l’infrastructure IA en Tunisie. Karim Beguir, originaire du sud de la Tunisie, s’est imposé comme une figure majeure de la communauté mondiale de l’IA, plaidant pour la place de la Tunisie dans l’avenir de l’intelligence artificielle.