Une récente étude menée par la chercheuse en nutrition Emma Beckett, de l’Université catholique d’Australie, publiée fin septembre 2026, met en lumière plusieurs effets surprenants du café sur l’organisme, qui ne sont pas principalement liés à la caféine. Ces résultats soulignent comment divers composés présents dans le café, au-delà du stimulant bien connu, peuvent influencer les fonctions corporelles de manières encore mal comprises. Pour environ trois personnes sur dix, boire du café peut déclencher l’envie d’aller aux toilettes dans les trente minutes qui suivent. Cet effet est également observé avec le café décaféiné, ce qui indique que la caféine n’en est pas la cause. D’autres composés du café stimulent directement le côlon, déjà plus actif au réveil. L’ajout de lait, de sucre ou d’édulcorants peut renforcer cet effet. Le café active également l’ensemble du système digestif. Même sans nourriture, il incite le pancréas à libérer de la trypsine, une enzyme qui décompose les protéines. Le café décaféiné produit la même réponse, ce qui rend difficile de déterminer si le café supprime ou augmente l’appétit. Ces effets sur la digestion se produisent indépendamment de la caféine. Boire du café peu de temps avant de prendre un médicament peut modifier l’action de ce dernier. Il réduit l’absorption de la lévothyroxine, utilisée dans le traitement de la thyroïde, et de l’alendronate, un traitement contre l’ostéoporose. Il ralentit également l’élimination de la clozapine, un antipsychotique. À l’inverse, un antibiotique comme la ciprofloxacine peut ralentir la dégradation de la caféine et prolonger ses effets. Dans la plupart des cas, espacer de quelques heures la prise de café et celle du médicament permet d’éviter ces problèmes. Le café affecte l’absorption du fer. Ses polyphénols et ses acides chlorogéniques se lient au fer d’origine végétale et en bloquent une grande partie. Cela est particulièrement important pour les personnes ayant de faibles réserves de fer ou suivant un régime sans viande. Retarder la consommation de café d’une heure après un repas peut réduire considérablement cet effet. Deux composés du café, le cafestol et le kahwéol, augmentent le taux de cholestérol total et de mauvais cholestérol (LDL). Cependant, ces mêmes molécules abaissent aussi le taux de lipoprotéine(a), un autre marqueur du risque cardiovasculaire. Les acides chlorogéniques semblent légèrement dilater les vaisseaux sanguins, mais l’impact global sur la santé cardiaque reste incertain. Dans l’intestin, les acides chlorogéniques nourrissent la flore intestinale, tout comme les mélanoïdines formées lors de la torréfaction, que les bactéries fermentent. De petites études indiquent que la composition du microbiote peut changer avec chaque tasse de café. La caféine augmente temporairement la pression à l’intérieur de l’œil, ce qui pose problème pour les personnes atteintes de glaucome. Elle peut aussi aggraver les reflux gastriques existants. Beaucoup de ces conclusions reposent sur des études limitées, et les experts appellent à approfondir les recherches sur des groupes plus larges.